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土壤基因组 DNA 提取试剂盒(磁珠法)

土壤基因组 DNA 提取试剂盒(磁珠法)
货号:MBD06
【概述】
本试剂盒采用具有独特分离作用的磁珠和缓冲液系统,可从样品中分离纯化高质量基因组 DNA。经特殊
包被的磁珠在一定条件下对目的 DNA 具有很强的亲和力,而当条件改变时,磁珠释放吸附的 DNA,能够达
到快速分离纯化 DNA 的目的。整个过程安全、便捷,提取的 DNA 纯度高。使用本试剂盒纯化的基因组 DNA
的 OD260/OD280 均在 1.7-2.0 之间,可以应用到 PCR、酶切、杂交等分子生物学实验。
【适用范围】
本试剂盒适合花坛土、花盆土、农田土、山林土、淤泥、红土、黑土、粉尘等多类土壤环境样本的提取
【试剂盒包装及组成】

【试剂盒包装及组成】

试剂盒组成

规格

10T

50T

100T

200T

裂解液 S06

6.6 mL×1

33 mL×1

66 mL×1

132 mL×1

裂解液 S2

3.3 mL×1

16.5 mL×1

33 mL×1

66 mL×1

磁珠

0.55 mL×1

1.4 mL×2

5.6 mL×1

11 mL×1

缓冲液 W3

5.5 mL×1

27.5 mL×1

55 mL×1

110 mL×1

漂洗液

/

1(空瓶)

1(空瓶)

1(空瓶)

洗脱液

4 mL×1

20 mL×1

40 mL×1

80 mL×1

使用说明书

1

1

1

1

磁铁

1

/

/

/


【储存条件】
 磁珠可以在室温下(15-25℃)运输,但请置于 2-8℃保存。


 其余试剂室温保存,有效期 12 个月,更长时间的保存可置于 2-8℃。缓冲液 W3 若出现混浊或沉淀,请将试
剂在冰箱或冰水浴中放置至澄清透明后使用。其余试剂 2-8℃保存条件下,若溶液产生沉淀,使用前应


将试剂盒内的溶液在室温放置一段时间,必要时可在 37℃水浴中预热 10 min 溶解沉淀,摇匀后使用。
土壤基因组 DNA 提取试剂盒(磁珠法) 1 / 4
版本 2019/01/15(01)
【注意事项】
 尽量使用新采取的土壤样本,不同样本在采样前应先查阅相应的最佳保存条件。
 整个裂解过程操作尽量温和,并在要求时间内完成。
 在需要吸取上清液的步骤中应避免吸到沉淀,以免影响产物纯度。

 客户自备材料:氯仿、异丙醇、无水乙醇、药匙、离心管、水浴锅、离心机(最大离心力≥12000 rpm/min
(~10010×g))。
 请于本实验开始前穿上实验服、佩戴手套及口罩,避免实验操作过程中试剂沾染皮肤、眼睛等,并防止
吸入口鼻。如不慎发生以上情况,请立即用清水冲洗,必要时请及时就医。

 使用前请预先在漂洗液瓶或离心管中配制 70%乙醇,并提前将水浴锅调至 65℃备用。

 磁珠在使用前一定要充分混匀。磁珠加入后,请尽量减少用枪头吹打混匀,防止磁珠沾在枪头上,造成
基因组 D A 损失。

【操作步骤】
1. 取土壤样本 250 mg 于 2 mL 离心管中,加入 200 μL 洗脱液,涡旋混匀,再加入 600 μL 裂解液
S06 涡旋振荡至样本混匀后,向离心管中加入 300 μL 裂解液 S2,颠倒混匀。
 本步骤土壤中加入裂解液后,可采用涡旋混匀的方式,使土壤完全处于悬浮状态。后续步骤中不建议再
采用涡旋混匀的方式,并注意操作尽量温和,以防止基因组 DNA 断裂。

 当样本量大于 250 mg 时,请按比例增大裂解液的体积,否则可能会影响 DNA 的得率及 DNA 溶液的颜色。

2. 将离心管置于 65℃,水浴 25-30 min,期间颠倒混匀数次。
3. 室温放置 3-5 min,加入 400 μL 氯仿(请于通风橱或生物安全柜中操作,注意防护),轻柔混匀
15 s,静置 3 min,12000 rpm(~10010×g)离心 5-10 min。
4. 取出离心管,小心吸取 700 μL 上清于新的 1.5 mL 离心管中,加入 500 μL 的缓冲液 W3,颠倒混
匀,12000 rpm(~10010×g)离心 5-10 min。
 吸取上清时,切勿吸取中间层(变性蛋白质等)。

 缓冲液 W3 若出现混浊或沉淀,请将试剂在冰箱或冰水浴中放置至澄清透明,摇匀后使用。
5. 取出离心管,小心吸取 1mL 上清于新的离心管(2 mL)中,加入等体积异丙醇,颠倒混匀 10
sec,再向离心管中加入 50 μL 磁珠,振荡混匀 1 min,室温静置 3 min,期间颠倒混匀 2 次。
 吸取上清时,请勿触及沉淀或管底。
 向离心管中加入磁珠之前,请确保磁珠彻底重悬,可在使用前振荡混匀。确保磁珠在结合过程中呈悬浮
状态。

6. 将离心管置于磁力架或磁铁上进行磁分离,吸弃废液,从磁力架或磁铁上取下离心管。
土壤基因组 DNA 提取试剂盒(磁珠法) 2 / 4
版本 2019/01/15(01)
 若离心管管口及管壁上沾有少量磁珠,请将磁珠重悬至离心管,可参考如下步骤:将离心管置于磁力架
上,待磁珠完全吸附于管壁后,上下颠倒磁力架,使沾在管口的磁珠重悬至溶液中,避免磁珠损失。
 
 吸弃废液时,尽量吸净管盖及管底残液,请勿吸入磁珠。

 从磁力架或磁铁上取下离心管后,若离心管中仍有废液,可再次磁分离,吸弃废液。

 本公司有多功能磁力架(Mag0103),无需使用移液器吸净废液,直接倾斜磁力架将废液倒出即可,可
根据需要购买。

7. 向离心管中加入 600 μL 漂洗液(使用前请预先配制 70%乙醇),轻柔混匀 1-2 min,将离心管置
于磁力架或磁铁上进行磁分离,吸弃废液。
 若离心管管口及管壁上粘有少量磁珠,请将磁珠重悬至离心管。
 吸弃废液时,尽量吸净管盖及管底残液,请勿吸入磁珠。
8. 重复步骤 7 一次。
 若离心管管口及管壁上粘有少量磁珠,请将磁珠重悬至离心管。

 吸弃废液时,尽量吸净管盖及管底残液,请勿吸入磁珠。

 为缩短后续晾干时间,可将离心管 10000 rpm(~6953×g)离心 1 min,再置于磁力架或磁铁上进行磁分
离,再次吸弃废液。

9. 室温开盖晾干 5-10 min(可将离心管开盖置于超净工作台风口或吹风机冷风口),至乙醇完全挥
发(侧面观察磁珠无反光;反面观察磁珠颜色由棕黑色变为深褐色,边缘龟裂;无液体挂壁)。
 室温晾干前,请先尽量吸净残液。乙醇残留会抑制后续的酶反应(如酶切、PCR 等)实验,应确保乙醇
完全挥发后再进行下一步操作。但也不能干燥太久(磁珠不能完全龟裂),以免 DNA 难以洗脱。

10. 从磁力架或磁铁上取下离心管,加入 100 μL 洗脱液,振荡混匀,65℃水浴 10 min,每隔 2-3
min 轻摇离心管混匀 3-5 次。
 水浴前请先用洗脱液将离心管壁上的所有磁珠冲洗至离心管内。

 如有特殊需要,可使用等量的经高压灭菌的去离子水作为洗脱液。但应保证去离子水的 pH 值在 7.0-8.5
之间,若 pH 值不在此范围内,会影响洗脱效率及 DNA 质量。

11. 将离心管置于磁力架或磁铁上进行磁分离,小心吸取上清至新的离心管中,所得上清即目的基因
组 DNA,可直接进行下游实验或于适当条件保存。
 可先将离心管 10000 rpm(~6953×g)离心 1 min,再进行磁分离,以确保所有磁珠完全吸附至管壁。

 尽量吸净上清,但请勿吸入磁珠,以免影响基因组 DNA 的纯度及 DNA 溶液的颜色。

土壤基因组 DNA 提取试剂盒(磁珠法) 3 / 4
版本 2019/01/15(01)
【常见问题及参考意见】
1. 得率低  土壤样品保存不当:新采取的土壤样本会得到更高的得率,不同样本在采样前应先查阅相应的最佳保存
条件;
 
 结合不充分:结合过程中要使磁珠一直处于悬浮状态,并且充分颠倒混匀;

 取样量大于说明书给出量:取样量请严格按照说明书操作;
 操作过程中磁珠损失:操作过程中可能有少量磁珠沾在离心管管口或枪头上,应及时确保磁珠重悬至溶液
中,避免磁珠损失;

洗脱液 pH 不在推荐范围内:应使用本试剂盒配套洗脱液,如有特殊需要,可使用等量的经高压灭菌的去离子
水作为洗脱液。但应保证去离子水的 pH 值在 7.0-8.5 之间,若 pH 值不在此范围内,会影响洗脱效率;

洗脱温度不符合要求:洗脱过程需要 65℃水浴。65℃条件下磁珠与基因组 DNA 的作用力减弱,释放吸
附的大量基因组 DNA,而常温条件下只能少量的基因组 DNA。

2. D条带弥散,DNA 断裂、降解  样品不新鲜:请尽量选择新鲜的样品;

 裂解时间太长:裂解时间不要超过 60 min;

 样品没有按要求保存或反复冻融:需要保存的样品请分装后保存至相应的最佳条件,避免反复冻融造成 D
A 降解;
 
 操作过程过于剧烈:操作过程动作尽量温和,避免 DNA 被机械打断;

提取后模板 DNA 放置时间太长:提取后如有需要,请尽量及时进行凝胶电泳实验。短期内可置于 4℃保存,
长期请置于-20℃保存(尽量注意避免反复冻融)。

3. DNA 溶液有颜色  洗涤过程不充分:如果结合后磁珠呈团状、丝状或颗粒状,可适当增加振荡力度及次数;

 裂解不充分:将组织充分研磨、适当增加裂解液 S06 和 S2 用量,也可以延长裂解时间;

 样品用量大于说明书给出量而其他试剂用量没有相应调整:严格按照说明书操作,如果需要增大样本量,可以
等比例大裂解液 S06、S2 以及磁珠用量,其他试剂用量可不改变;
 
DNA 溶液中混入磁珠:洗脱结束后,可先将离心管 10000 rpm 离心 1 min,再进行磁分离,以确保所有
磁珠完全吸附至管壁。为防止吸入磁珠,可重复进行磁分离一次。

4. DNA 样品不纯,干扰后续实验  DNA 溶液有乙醇残留:吸弃废液时,请尽量吸净管盖及管底残液。为缩短后续晾干时间,可将离心管
10000 rpm(~6953×g)离心 1 min,再置于磁力架或磁铁上进行磁分离,再次吸弃废液。室温晾干至磁珠
表面无反光、无液体挂壁;

 磁珠洗涤不充分:加入 70%乙醇时,请确保所有磁珠均重悬于液体中,并充分振荡混匀;

DNA 溶液中吸入磁珠:如果不小心吸入磁珠,请将上清液返回原管,待磁珠完全吸附至管壁后重新吸取上
清。或者将吸取的上清液 10000 rpm(~6953×g)离心 1 min,再取上清;

 DNA 溶液中含有蛋白质等杂质:建议适当减少样品用量;

DNA 溶液中含有轻微盐离子等杂质,此为洗脱液正常现象,不影响下游实验。如有特殊需要,可使用等量的
经高压灭菌的去离子水作为洗脱液。为方便实验,可将获得的 DNA 溶液置于-20℃环境分装保存。

 
电话:010-64938852 传真:010-64938852
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